การเล่นฟุตซอลในประเทศไทยไม่เป็นที่ปรากฏแน่ชัดว่ามีมาตั้งแต่เมื่อใด แต่มีเกมการเล่นชนิดหนึ่งที่เรียกว่า “ฟุตบอลโกล์หนู” มีรูปแบบคล้ายกับฟุตซอล เพียงแต่ฟุตบอลโกล์หนูไม่มีผู้รักษาประตู การเล่นก็แบ่งทีมออกเป็นฝ่ายละ 5 คน ใช้ลูกบอลพลาสติก แล้วหาพื้นที่ว่างสักแห่งในการเล่น ส่วนฟุตซอล (อินดอร์ซอคเกอร์) ไม่เป็นทีนิยมมากในเวลานั้น อาจจะมาจากไม่มีสถานที่รองรับหรือไม่มีการจัดการแข่งขันอย่างเป็นทางการ
จนกระทั่งเมื่อ พ.ศ.2540 สมาคมฟุตบอลแห่งประเทศไทยในพระบรมราชูปถัมภ์ กรุงเทพมหานคร การกีฬาแห่งประเทศไทย และเดอะมอลล์ กรุ๊ป จำกัด ร่วมกันจัดการแข่งขันฟุตบอล 5 คน (ฟุตบอล 5 คน คือคำที่ใช้เรียก Futsal ในประเทศไทย) ในรายการ STAR IN DOOR SOCCER 1997เมื่อวันที่ 12–21กรกฎาคม พ.ศ. 2540 ณ เดอะมอลล์ บางกะปิ โดยมี 12 ทีมสโมสรชั้นนำจากไทยแลนด์ลีกเข้าร่วมการแข่งขัน ผลการแข่งขันปรากฏว่าทีมการท่าเรือแห่งประเทศไทยชนะเลิศ
ในพ.ศ. 2541 ได้จัดการแข่งขันฟุตบอล 5 คน ขึ้นอีกเป็นครั้งที่ 2 ทีมกรุงเทพมหานครชิงชนะเลิศกับแชมป์เก่าสโมสรการท่าเรือแห่งประเทศไทย เอาชนะแชมป์เก่าคว้าแชมป์ไปครอง
พ.ศ.2543 ได้มีการจัดการแข่งขันฟุตซอลขึ้นเป็นครั้งที่ 3 โดยมีการแข่งขันรอบคัดเลือกในแต่ละภาคเพื่อนำทีมชนะเลิศและรองชนะเลิศมาแข่งขันกับทีมสโมสรชั้นนำจากไทยลีกในการแข่งขันฟุตซอลชิงชนะเลิศแห่งประเทศไทย ซึ่งจากความสำเร็จในการแข่งขันครั้งนี้ทำให้กีฬาฟุตซอลเป็นที่นิยมมากยิ่งขึ้นต่อมาประเทศไทยได้มีโอกาสเป็นเจ้าภาพจัดการแข่งขันฟุตซอลชิงแชมป์เอเชีย และจากการแข่งขันดังกล่าวทำให้ประเทศไทยได้อันดับสามและได้สิทธิ์เดินทางไปแข่งขันฟุตซอลชิงแชมป์โลก ครั้งที่ 4 ระหว่างวันที่ 18 พฤศจิกายน – 3 ธันวาคม พ.ศ. 2543 ณ ประเทศกัวเตมาลา
พ.ศ. 2544 มีการจัดการแข่งขันทั้งในระดับภูมิภาคและระดับประเทศ ทั้งระดับเยาวชนและประชาชน เช่น การแข่งฟุตซอล ควิก จูเนียร์ฟุตซอลไทยแลนด์ แชมป์เปี้ยนชิพ และอัมเทล ฟุตซอลไทยแลนด์แชมป์เปี้ยนชิพ 2001 อีกทั้งทีมชาติไทยสามารถสร้างผลงาน ชนะเลิศระดับอาเซียน ที่ประเทศมาเลเซีย และชนะเลิศระดับดิวิชั่น 2 ไทเกอร์คัพ ที่ประเทศสิงคโปร์ปัจจุบันกีฬาฟุตบอล 5 คน หรือฟุตซอลในประเทศไทยได้รับความนิยมอย่างแพร่หลายในหมู่เยาวชน เนื่องจากมีสนามแข่งที่สะดวกสบาย จำนวนผู้เล่นไม่มากเกินไป และที่สำคัญคือ ฟุตซอลทีมชาติไทยเป็นทีมระดับแถวหน้าในทวีปเอเชีย ทำให้เยาวชนจำนวนมากใฝ่ฝันที่จะติดทีมชาติไทยต่อไปในอนาคต